流域内由于美国工业和农业的不断发展，忽略了环境的保护，工业的发展到处排放污水，把河当成自己的排污池；农业的发展，大量的使用的农药、化肥；两岸的人们，肆意的将人类生活废水排入河内，三股黑色的力量将带密西西比河带入了万劫不复的深渊，引起了河流水质不断恶化。同时，大量水利工程的修建影响了河水的流动，水体自净能力下降，破坏了营养物质和有毒有害物质在水和沉积物中的吸附和解吸，导致该河经常爆发蓝藻水华等水污染事件的发生。

如何治理这些污染?成了他们的头等大事，为了治理污染，美国拼了。

二是制度治理污染

1970年，美国白宫将早期出台的《垃圾法》作为治理工业废水的工具，并因此建立了污水排放许可证制度，工业排污者需要获得联邦政府发放的排放许可证才可以进行排放。该制度的实施，一定程度上迫使大量企业做出改变，减少了工业废水的排放。

1972年，美国联邦政府颁布了《清洁水法案》，全面治理全国的水污染问题。法案禁止所有工厂排放污水，要求工业污水在排入水体前必须进行处理。

三是淡水鱼治污染

同时他们还想出了用水生生物治理水体污染的办法，比如引进一些能够净化水质的淡水鱼，这样花的成本会非常低，只需要引进少部分，然后让鱼自然繁殖即可。